Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CltaO08585 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltaO08585 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltaO08585 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltaO08585 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CltaO08585 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CltaO08585 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CltaO08585 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CltaO08585 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CltaO08585 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CltaO08585 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CltaO08585 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CltaO08585 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CltaO08585 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CltaO08585 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CltaO08585 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms