Protein–RNA interactions for Protein: L7N479

Tcrg-C3, T cell receptor gamma, constant 3, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C3L7N479 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tcrg-C3L7N479 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tcrg-C3L7N479 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tcrg-C3L7N479 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tcrg-C3L7N479 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tcrg-C3L7N479 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tcrg-C3L7N479 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tcrg-C3L7N479 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tcrg-C3L7N479 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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