Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8271L7N2E2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8271L7N2E2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8271L7N2E2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms