Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3043K7N693 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3043K7N693 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3043K7N693 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms