Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa3bJ9JI28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms