Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccer2J3QPU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms