Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8356J3QPD3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8356J3QPD3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8356J3QPD3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8356J3QPD3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8356J3QPD3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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