Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gm19965J3QNY8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Gm19965J3QNY8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Gm19965J3QNY8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Gm19965J3QNY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Gm19965J3QNY8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Gm19965J3QNY8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm19965J3QNY8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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