Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21976J3QNN2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm21976J3QNN2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm21976J3QNN2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21976J3QNN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms