Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20834J3QM72 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20834J3QM72 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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