Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930544D05RikJ3QK56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms