Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34c3J3QJW5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c3J3QJW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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