Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21820J3KMU2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21820J3KMU2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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