Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp16-psI6L890 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms