Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pot1bH7BX60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms