Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r12G5E8G1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms