Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sclt1G5E861 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sclt1G5E861 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms