Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcf11G3X9Z4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcf11G3X9Z4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcf11G3X9Z4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcf11G3X9Z4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms