Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hmgxb3G3X9M3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms