Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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1700067P10RikG3X8U2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700067P10RikG3X8U2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700067P10RikG3X8U2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms