Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Nkx1-1G3UXB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx1-1G3UXB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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