Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms