Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BicraF8VPZ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BicraF8VPZ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BicraF8VPZ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms