Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Colca2F8VPY8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Colca2F8VPY8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms