Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp9yF8VPU6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp9yF8VPU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms