Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-M1F7CXU4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M1F7CXU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms