Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17654F7AXR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17654F7AXR3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms