Protein–RNA interactions for Protein: F6XVS9

Gm8922, Predicted gene 8922, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8922F6XVS9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8922F6XVS9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8922F6XVS9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms