Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm10378F6XQQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm10378F6XQQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm10378F6XQQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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Gm10378F6XQQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm10378F6XQQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm10378F6XQQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm10378F6XQQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm10378F6XQQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gm10378F6XQQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm10378F6XQQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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