Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Crocc2F6XLV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Crocc2F6XLV1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Crocc2F6XLV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms