Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21974F6W3F3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21974F6W3F3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21974F6W3F3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms