Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5861F6VCN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms