Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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