Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm340F6RGI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms