Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29094F6Q785 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29094F6Q785 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms