Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf4E9QAP7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Taf4E9QAP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms