Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms