Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms