Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r152E9Q9N3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r152E9Q9N3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms