Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrdnE9Q9K5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms