Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aknad1E9Q8N6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Aknad1E9Q8N6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aknad1E9Q8N6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms