Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Arhgef5E9Q7D5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Arhgef5E9Q7D5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Arhgef5E9Q7D5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms