Protein–RNA interactions for Protein: E9Q735

Ube4a, Ubiquitin conjugation factor E4 A, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube4aE9Q735 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube4aE9Q735 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube4aE9Q735 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube4aE9Q735 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms