Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp31E9Q6Y8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms