Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms