Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc71lE9Q4T4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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