Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApobE9Q414 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms