Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd1E9Q3H4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Susd1E9Q3H4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms