Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aldh3b2E9Q3E1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aldh3b2E9Q3E1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms