Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms